Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK5

AGO4, Protein argonaute-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGO4Q9HCK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGO4Q9HCK5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGO4Q9HCK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGO4Q9HCK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms