Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RPAP3Q9H6T3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP3Q9H6T3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAP3Q9H6T3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms