Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SENP3Q9H4L4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SENP3Q9H4L4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms