Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NKX2-4Q9H2Z4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-4Q9H2Z4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms