Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKRN2Q9H000 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKRN2Q9H000 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms