Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE41Q9C0J9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE41Q9C0J9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms