Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM7Q9C029 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM7Q9C029 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms