Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXP3Q9BZS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXP3Q9BZS1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms