Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCO2Q9BYV7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCO2Q9BYV7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms