Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDHR2Q9BYE9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms