Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms