Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VN1R3Q9BXE9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VN1R3Q9BXE9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms