Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CINPQ9BW66 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CINPQ9BW66 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms