Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB2BQ9BVA1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms