Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
C9orf16Q9BUW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms