Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHRDL1Q9BU40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms