Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM56Q9BRZ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM56Q9BRZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms