Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH2D3AQ9BRG2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D3AQ9BRG2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms