Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC77Q9BR77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC77Q9BR77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms