Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLSTN3Q9BQT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN3Q9BQT9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN3Q9BQT9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms