Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE5

APOL2, Apolipoprotein L2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL2Q9BQE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL2Q9BQE5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL2Q9BQE5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms