Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF25Q9BQ70 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF25Q9BQ70 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms