Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TREX2Q9BQ50 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TREX2Q9BQ50 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms