Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGPAT1Q99943 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGPAT1Q99943 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms