Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRG3Q99928 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRG3Q99928 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms