Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L3Q99457 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms