Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RMDN3Q96TC7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RMDN3Q96TC7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN3Q96TC7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms