Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMS19Q96T76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms