Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCCC1Q96RQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms