Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ALS2Q96Q42 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALS2Q96Q42 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms