Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMG1Q96Q15 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMG1Q96Q15 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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