Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF3Q96PU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms