Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms