Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD11Q96NU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD11Q96NU1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms