Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms