Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RILPQ96NA2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RILPQ96NA2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms