Protein–RNA interactions for Protein: Q96N96

SPATA13, Spermatogenesis-associated protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA13Q96N96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPATA13Q96N96 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPATA13Q96N96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms