Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM20AQ96MK3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM20AQ96MK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms