Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGD4Q96M96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGD4Q96M96 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms