Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRRC1Q96M27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms