Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCZQ96LD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms