Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJD4Q96KN9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJD4Q96KN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms