Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COG3Q96JB2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
COG3Q96JB2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms