Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEC22AQ96IW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22AQ96IW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms