Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHDQ96IW2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms