Protein–RNA interactions for Protein: Q96I34

PPP1R16A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R16AQ96I34 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R16AQ96I34 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R16AQ96I34 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R16AQ96I34 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms