Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSANTD3Q96H12 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSANTD3Q96H12 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms