Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTV1Q96GA3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTV1Q96GA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTV1Q96GA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms