Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMIM12Q96EX1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms