Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP36Q96EU6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP36Q96EU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms